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Nossos Projetos

Nossos Softwares e Soluções Computacionais

1. The LDGH-Mosaico Scientific Workflow

Uma ferramenta de knowledge management bioinformático

2. CNVice

Estima frequências alélicas e coeficientes de inbreeding a partir de diplótipos de loci de Copy Number Variation. Utiliza um enfoque de máxima verossimilhança e um algoritmo de EM.

3. DANCE: Disease Ancestry Network Webtool

Ferramenta que usa a teoria de redes complexas para integrar, sumarizar e visualizar informação de bancos de dados biológicos. DANCE mostra dinamicamente informações sobre hits de GWAS de doenças complexas do GWAS Catalog, e informação sobre frequências alélicas em diferentes populações humanas extraidas do 1000 Genomes Project.

4. MASSA: Multi-agent System for SNPs-annotation

Ferramenta que usa a tecnologia de sistemas multi-agente para recuperar e integrar informações de 11 bancos de dados biológicos e anotar variantes genéticas.

5. DIVERGENOME

Um banco de dados relacional (DIVERGENOMEdb) e um pipeline dinâmico (DIVERGENOMEtools) para estudos de genética de populações e epidemiologia genética.

6. NATORA: Network Algorithm for Relatedness Analysis

Algoritmo que a partir de uma matriz de similaridade, modela relações de parentesco como redes complexas e identifica o menor número possível de observações (indivíduos) para excluir da amostra, com o objetivo de obter a máxima redução dos níveis de parentesco.

Projeto EPIGEN-Brasil:

Projeto EPIGEN-Brasil:

Uma iniciativa estratégica e multicêntrica financiada pelo Ministério de Saúde para determinar a interação entre a arquitetura genética de doenças complexas e miscigenação (obesidade, hipertensão, Chagas, asma, doenças cardiovasculares, envelhecimento) no Brasil.

Disponível em:


Financiador
  • Ministério de Saúde/FINEP
Colaboradores
  • Instituto do Coração (Universidade de São Paulo)
  • Fundação Oswaldo Cruz
  • Universidade Federal de Pelotas
  • Universidade Federal da Bahia
Biomarcadores Farmacogenéticos em América Latina

Biomarcadores Farmacogenéticos em América Latina

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Disponível em:


Colaboradores
  • Rede Iberoamericana de Farmacogenética
  • Universidad de Extremadura
Genética do câncer gástrico em América Latina

Genética do câncer gástrico em América Latina

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Disponível em:


Financiador
  • US-National Institutes of Health
  • National Cancer Institute e Fogarty International Center
Colaboradores
  • Johns Hopkins University
  • Universidad Peruana Cayetano Herédia
Medicina Evolutiva e ancestralidade indígena em América Latina

Medicina Evolutiva e ancestralidade indígena em América Latina

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Disponível em:


Colaboradores
  • Johns Hopkins University
  • Universidad Peruana Cayetano Herédia
  • Instituto Nacional de Salud (Peru)